Postdoctoral Researcher in Protist Single-Cell Genomics

Ønsker du at flytte grænserne for teknologi til at aflæse genomerne af ukultiverede, encellede eukaryoter, der former økosystemer over hele vores planet? Ved Aalborg Universitets Institut for Kemi og Biovidenskab søger Aalborg Universitet en dygtig og motiveret Postdoc til at udvikle næste generations laboratoriemetoder til encelle-genomik og -transkriptomik af ukultiverede protister.

Stillingen er en del af et internationalt projekt finansieret af Gordon and Betty Moore Foundation og udføres i samarbejde med Earlham Institute, Scottish Association for Marine Science og Culture Collection of Algae and Protozoa. Ansættelsen begynder den 1. januar 2027 eller snarest derefter og er en tidsbegrænset stilling på 3 år.

Dine arbejdsopgaver

Du vil lede udviklingen af laboratorieteknologi til encelle-genomik af protister i tæt samarbejde med professor Ramunas Stepanauskas og hans gruppe. Protister er notorisk vanskelige at behandle på encelleniveau på grund af deres forskellige, ofte robuste cellevægge og intracellulære strukturer samt deres store, komplekse genomer. Dit arbejde vil adressere disse flaskehalse.

Nøgleopgaverne omfatter:

• Integrering af banebrydende teknologier, herunder dråbemikrofluidik med semipermeable kapsler, fluorescensaktiveret cellesortering og lang-læse sekventering, i analytiske arbejdsgange skræddersyet til protister i forskellige miljøprøver.
• Forbedring af encelle-lyse og DNA-amplifikationsmetoder skræddersyet til forskellige protistlinjer.
• Publicering af resultater i førende tidsskrifter og åben deling af protokoller med forskningsfællesskabet.

Du vil også have mulighed for at træne i bioinformatiske værktøjer til mikrobiel encelle-genomik gennem arbejde side om side med Aalborg Universitets bioinformatikteam.

Projektet involverer tæt samarbejde med partnerlaboratorier i Storbritannien og USA, herunder delte benchmarkprøver, forskningsophold og workshops. Dette gør det til en stærk platform for at opbygge forskellige, internationale forskningserfaringer og professionelle netværk.

Dine kompetencer

Du skal have en ph.d.-grad i mikrobiologi, bioteknologi eller et beslægtet felt (eller forventes at færdiggøre den inden startdatoen) og have en dokumenteret track record af førsteforfatterpublikationer i internationale peer-reviewed tidsskrifter.

Den ideelle kandidat har dokumenteret praktisk erfaring med en eller flere af følgende: molekylære laboratoriemetoder, herunder nukleinsyreekstraktion, helgenomamplifikation, bibliotekspræparation og sekventering; genomik eller transkriptomik af mikroorganismer; mikrofluidik eller dråbebaserede metoder; og flowcytometri og cellesortering.

Erfaring med protister eller andre mikrobielle eukaryoter, samt enten erfaring med eller stærk interesse for bioinformatik, er en fordel.

Fremragende mundtlige og skriftlige kommunikationsevner på engelsk er essentielle, ligesom ægte entusiasme for at arbejde i et samarbejdsorienteret, tværfagligt og internationalt forskningsmiljø.

Om Aalborg Universitet

Stillingen er placeret ved Center for Mikrobielle Samfund, som samler omkring 50 forskere på forskellige karrierestadier for at studere strukturen og funktionen af mikrobielle samfund i miljømæssige og bioteknologiske sammenhænge.

Centret er en del af Institut for Kemi og Biovidenskab, et dynamisk knudepunkt for forskning og uddannelse, der genererer grundlæggende viden og adresserer globale udfordringer inden for biologi, kemi, bioteknologi, bioingeniørvidenskab, miljøvidenskab og kemiteknik.

Du vil blive en del af et nyetableret, topmoderne laboratorium for mikrobiel encelle-genomik, ledet af professor Ramunas Stepanauskas, som grundlagde verdens første encelle-genomikcenter for miljømikroorganismer.

Stillingen er placeret på Aalborg Universitets campus i Aalborg, en levende dansk by kendt for arkitektur i verdensklasse, en blomstrende kulturscene og ungdommelig energi drevet af den store studenterpopulation.

Med den fantastiske nordjyske natur lige udenfor døren og et leveomkostningsniveau, der ligger et godt stykke under Københavns, kombinerer Aalborg Universitet et banebrydende akademisk miljø med en fremragende livskvalitet.

Aalborg Universitet er engageret i at gøre Aalborg Universitets institut til et enestående sted at arbejde og studere. Udover fleksible arbejdstider og en fuld kalender med sociale arrangementer på både institut- og sektionsniveau fremmer Aalborg Universitet en kultur af åbenhed, nysgerrighed, gennemsigtighed og ægte inklusion.

Aalborg Universitet respekterer og fejrer mangfoldigheden af individer, samfund og kulturer, der gør Aalborg Universitet til det, det er. Aalborg Universitet vil gerne byde dig velkommen!

Læs mere om instituttet her: https://www.en.bio.aau.dk/

Kvalifikationskrav

Ansættelse som postdoc kræver akademiske kvalifikationer på ph.d.-niveau.

Sådan ansøger du

Din ansøgning skal inkludere følgende:

• Ansøgning, der angiver grunde til at søge, kvalifikationer i forhold til stillingen samt intentioner og visioner for stillingen.
• Curriculum Vitae (CV).
• Diplomer (kandidatdiplom og ph.d.-diplom).
• Liste over publikationer, med angivelse af de vedhæftede publikationer, du ønsker skal indgå i vurderingen. Du må vedhæfte maksimalt fem publikationer.
• Dokumentation for undervisningskvalifikationer, hvis relevant.
• Formidlingskvalifikationer, herunder deltagelse i udvalg eller bestyrelser, deltagelse i organisationer mv.
• Yderligere kvalifikationer i relation til stillingen.
• Referencer/anbefalinger.

Du kan læse mere om kravene til din ansøgning her.

Ansøgningen skal indsendes via Aalborg Universitets rekrutteringssystem, som kan tilgås under jobannoncen på Aalborg Universitets hjemmeside.